提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
湖北推进高价值专利培育 助力科技自立自强******
中新网武汉1月10日电 (马芙蓉 林治国)记者10日从2023年湖北省知识产权局局长会议上获悉,2022年该省深入实施高价值专利培育工程,引导创新主体突破关键核心技术,形成核心自主知识产权,推动产业迈向价值链中高端,高价值专利培育体系日趋完善,助力科技自立自强举措更实。
2022年,湖北省知识产权局围绕创新主体培育,实施企业知识产权发展“百千万计划”,发布100家专利优势企业、100名发明专利领军人才名单,打造高价值专利培育示范样板,该省国家知识产权示范企业达60家、优势企业270家。
聚焦湖北“51020”现代产业集群,该局于2022年启动10个产业导航项目,服务重点产业专利布局,组织开展OLED产业链等专利导航成果系列发布活动。此外,出台服务企业创新发展若干措施,加强与相关部门合作对接,缩短企业高价值发明专利审查周期。
“2023年,我们将实施知识产权服务产业高质量发展专项行动。”湖北省知识产权局局长刘治田表示,将围绕湖北五大优势产业及细分行业领域,打造一批高价值专利培育中心,做细做优专利导航服务基地,启动一批优势企业导航项目,提升产业链、供应链韧性和安全性。
据统计,2022年1-11月,湖北专利授权总量为14.6万件,同比增长8.4%,其中发明专利授权2.74万件,同比增长30.8%。截至2022年11月,该省有效发明专利拥有量11.61万件,每万人口发明专利拥有量20.1件。
该省知识产权转化运用实现突破。2022年湖北全省专利转让许可24341次,同比增长29.67%;开展知识产权质押融资入园惠企活动,全年专利质押融资额63.23亿元,同比增长54.7%。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎)