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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

阿里山姑娘会遇到“恐怖情人”？国台办回应******

　　中新网1月11日电 国台办发言人马晓光11日表示，“台独”浊浪弥漫台湾校园，使大陆家长和学生望而却步。岛内没有陆生，责任在谁，一目了然。

　　11日，国台办举行例行新闻发布会。有记者提问：最后一批在台大陆学生现在大四，暑假毕业后即“清零”，台湾将没有大陆的学士生。请问后疫情时代，大陆是否愿开放陆生来台？

　　对此，马晓光表示，我们推动两岸同胞恢复正常交流往来，政策信号是清晰的，态度是坚定的。大陆学生赴台就读学位生，是两岸关系和平发展的产物。民进党上台以来，几乎将两岸关系和平发展成果破坏殆尽。“台独”浊浪弥漫台湾校园，使大陆家长和学生望而却步。岛内没有陆生，责任在谁，一目了然。道理很清楚，在“九二共识”基础上推动两岸关系改善与发展，就能不断增进两岸同胞的利益和福祉。

　　该记者还问发言人：我们注意到，解放军日前发布了一首MV《我的战鹰绕着宝岛飞》，其中歌词写道“我的战鹰绕着宝岛飞，听阿里山的姑娘不断回味。”歌词很温情，但是画面会让台湾民众误以为大陆要“开战”，担心阿里山姑娘会遇到“恐怖情人”。对此有何评论？大陆是否考虑过如何消除台湾民众的疑虑？

　　马晓光指出，我愿意再次重申，要和平、要发展、要交流、要合作，要过好日子，是两岸同胞的共同心声，符合两岸同胞共同利益，但“台独”分裂势力和外部势力却不这么想。中国人民解放军开展对台军事演练，针对的是“台独”分裂和外部干涉，不是针对广大台湾同胞，目的是维护国家主权和领土完整、维护台海地区和平稳定、维护两岸同胞的共同利益。只要不搞“台独”，就没什么可担心的。在此，也请你转告阿里山的姑娘，“台独”分裂势力，才是她们要担心的“恐怖情人”。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）